Takaisin Tulosta

Mycoplasma pneumoniaen tunnistaminen nukleiinihappomonistuksella

Lisätietoa aiheesta
Martti Vaara
18.8.2008

Mycoplasma pneumoniaen ja Chlamydia pneumoniaen osoittaminen konventionaalisilla viljelyyn perustuvilla menetelmillä on hidasta ja epäherkkää eikä sovellu siksi primaariseen differentiaalidiagnostiikkaan ohjaamaan yksittäisten potilaiden hoitoa.

Nukleiinihappojen monistukseen perustuvat menetelmät ovat osoittaneet kykynsä antaa nopeita, herkkiä ja spesifejä tuloksia, ja niitä pidetään parhaana menetelmänä mykoplasman suoraksi osoittamiseksi «Daxboeck F, Krause R, Wenisch C. Laboratory diagno...»1, «Murdoch DR. Molecular genetic methods in the diagn...»2. Näitä menetelmiä on evaluoitu parissakymmenessä kliinisiä näytteitä analysoineessa tutkimuksessa, jotka ovat eronneet toisistaan muun muassa analyysimenetelmien, potilasmateriaalin ja näytemateriaalin suhteen. Asianmukaisen validoinnin ja standardoinnin puutteen vuoksi tulokset eivät ole keskenään helposti vertailukelpoisia, mutta nukleiinihappomenetelmien ja mykoplasmaserologian välillä on kuitenkin selkeä korrelaatio.

Tuoreemmissa tutkimuksissa on verrattu useita erilaisia nukleiinihappoperusteisia menetelmiä keskenään ja todettu niiden välillä erinomainen korrelaatio «Templeton KE, Scheltinga SA, Graffelman AW ym. Com...»3, «Ursi D, Dirven K, Loens K ym. Detection of Mycopla...»4. Useissa tutkimuksissa on toisaalta löydetty mykoplasma-DNA:ta potilaista, joilla ei ole havaittavissa serologista vastetta «Templeton KE, Scheltinga SA, Graffelman AW ym. Com...»3, «Murdoch DR, Anderson TP, Beynon KA ym. Evaluation ...»5. Mykoplasma saattaa kolonisoida hengitysteitä ilman varsinaista taudin puhkeamista «Murdoch DR, Anderson TP, Beynon KA ym. Evaluation ...»5.

Näyte mykoplasman osoittamiseksi nukleiinihappomenetelmillä voidaan ottaa nenänielu-imunäytteenä tai tikkunäytteenä nielusta. Nenänieluerite sisältää enemmän nukleiinihappomonistusta häiritseviä agensseja. DNA-perusteinen testi voi pysyä jopa yli kuukauden ajan positiivisena mykoplasmaan tehoavan hoidon aloittamisen jälkeen «Murdoch DR, Anderson TP, Beynon KA ym. Evaluation ...»5.

Nielunäytteen PCR-testi saattaa olla paras käytössä oleva menetelmä mykoplasmapneumonian diagnostiikassa, mutta standardisoituja toimintaohjeita ja tutkimuksia, joissa PCR-testiä verrataan muihin menetelmiin, tarvitaan lisää, ennen kuin menetelmä voidaan ottaa yleiseen käyttöön «Murdoch DR, Anderson TP, Beynon KA ym. Evaluation ...»5.

Chlamydia pneumoniae

Nukleiinihappojen monistukseen perustuvat menetelmät ovat vähintäänkin yhtä herkkiä kuin klamydiaviljely, mutta menetelmien spesifisyyttä on ollut vaikea arvioida tarkoitukseen soveltuvan kultaisen standardin puutteen vuoksi «Murdoch DR. Molecular genetic methods in the diagn...»6. Eräissä tutkimuksissa on todettu ylähengitystienäytteistä saatavan useammin positiivinen löydös kuin alahengitystienäytteistä «Verkooyen RP, Willemse D, Hiep-van Casteren SC ym....»7; tämä saattaa viitata siihen, että osa löydöksistä kuvastaa pikemminkin kolonisaatiota kuin varsinaista invasiivista tautia «Murdoch DR. Molecular genetic methods in the diagn...»6. Erittäin herkkien PCR-testien ongelmana voi olla myös laboratoriossa tapahtuva kontaminaatio «Apfalter P, Assadian O, Blasi F ym. Reliability of...»8. Stardardoidun toimintaohjeen ja metodologian avulla sekä kokemuksien karttuessa «Dowell SF, Peeling RW, Boman J ym. Standardizing C...»9 saataneen lisää tietoa PCR-testien kliinisestä käyttökelpoisuudesta «Dowell SF, Peeling RW, Boman J ym. Standardizing C...»9, «Mandell LA, Wunderink RG, Anzueto A ym. Infectious...»10.

Kirjallisuutta

  1. Daxboeck F, Krause R, Wenisch C. Laboratory diagnosis of Mycoplasma pneumoniae infection. Clin Microbiol Infect 2003;9:263-73 «PMID: 12667235»PubMed
  2. Murdoch DR. Molecular genetic methods in the diagnosis of lower respiratory tract infections. APMIS 2004;112:713-27 «PMID: 15638835»PubMed
  3. Templeton KE, Scheltinga SA, Graffelman AW ym. Comparison and evaluation of real-time PCR, real-time nucleic acid sequence-based amplification, conventional PCR, and serology for diagnosis of Mycoplasma pneumoniae. J Clin Microbiol 2003;41:4366-71 «PMID: 12958270»PubMed
  4. Ursi D, Dirven K, Loens K ym. Detection of Mycoplasma pneumoniae in respiratory samples by real-time PCR using an inhibition control. J Microbiol Methods 2003;55:149-53 «PMID: 14500006»PubMed
  5. Murdoch DR, Anderson TP, Beynon KA ym. Evaluation of a PCR assay for detection of Streptococcus pneumoniae in respiratory and nonrespiratory samples from adults with community-acquired pneumonia. J Clin Microbiol 2003;41:63-6 «PMID: 12517826»PubMed
  6. Murdoch DR. Molecular genetic methods in the diagnosis of lower respiratory tract infections. APMIS 2004;112:713-27 «PMID: 15638835»PubMed
  7. Verkooyen RP, Willemse D, Hiep-van Casteren SC ym. Evaluation of PCR, culture, and serology for diagnosis of Chlamydia pneumoniae respiratory infections. J Clin Microbiol 1998;36:2301-7 «PMID: 9666010»PubMed
  8. Apfalter P, Assadian O, Blasi F ym. Reliability of nested PCR for detection of Chlamydia pneumoniae DNA in atheromas: results from a multicenter study applying standardized protocols. J Clin Microbiol 2002;40:4428-34 «PMID: 12454131»PubMed
  9. Dowell SF, Peeling RW, Boman J ym. Standardizing Chlamydia pneumoniae assays: recommendations from the Centers for Disease Control and Prevention (USA) and the Laboratory Centre for Disease Control (Canada). Clin Infect Dis 2001;33:492-503 «PMID: 11462186»PubMed
  10. Mandell LA, Wunderink RG, Anzueto A ym. Infectious Diseases Society of America/American Thoracic Society consensus guidelines on the management of community-acquired pneumonia in adults. Clin Infect Dis 2007;44:S27-72 «PMID: 17278083»PubMed