Takaisin Tulosta

Nopeat multiplex-PCR-paneelit keuhkokuumeen diagnostiikassa ja hoidon ohjauksessa

Lisätietoa aiheesta
Kaisu Rantakokko-Jalava
17.1.2024

Markkinoille on tullut kaupallisia multiplex-PCR-paneeleja, joilla voidaan osoittaa useita (yli 20) hengitystieinfektioita aiheuttavia bakteereja ja viruksia käsittelemättömästä alahengitystienäytteestä alle kahdessa tunnissa. Testin tunnistamat kohteet vaihtelevat hieman testiversiosta riippuen mutta sisältävät tyypillisesti tavallisimmat kotisyntyisen (Streptococcus pneumoniae ja Haemophilus influenzae) ja sairaalasyntyisen (Staphylococcus aureus, monet enterobakteerit ja Pseudomonas aeruginosa) bakteeripneumonian aiheuttajat sekä jälkimmäisiin liittyviä resistenssitekijöitä. Lisäksi voidaan todeta niin sanottuja atyyppisiä bakteeriaiheuttajia (Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumoniae ja Chlamydophila pneumoniae) sekä viruksista ainakin adeno-, influenssa A ja B, RS-, metapneumo- ja joitakin koronaviruksia.

Tulokset ovat käytettävissä selvästi nopeammin kuin bakteeriviljelyjen tai erikoislaboratoriossa tehtävien PCR-tutkimusten tulokset «Serigstad S, Markussen D, Grewal HMS, ym. Rapid sy...»1. PCR-paneeli toteaa noin kaksinkertaisen määrän löydöksiä per näyte verrattuna bakteeriviljelyyn «Serigstad S, Markussen D, Grewal HMS, ym. Rapid sy...»1, «Andrews V, Pinholt M, Schneider UV, ym. Performanc...»2, «Rand KH, Beal SG, Cherabuddi K, ym. Performance of...»3. Tämä johtunee PCR:n kyvystä todeta pienempiä bakteerimääriä «Rand KH, Beal SG, Cherabuddi K, ym. Performance of...»3, joidenkin bakteerien (H. influenzae) huonosta viljeltävyydestä sekä potilaan ennen näytteenottoa saamista antibioottihoidoista. Useat näytteet ovat positiivisia monen bakteerin ja viruksen suhteen, ja bakteereita on hyvin usein todettavissa myös sellaisilta potilailta, joilla ei kliinisesti ole pneumoniaa «Serigstad S, Markussen D, Grewal HMS, ym. Rapid sy...»1, «Andrews V, Pinholt M, Schneider UV, ym. Performanc...»2. Sekä bakteeriviljelyn että PCR-testien kyky erotella keuhkokuume bakteerikolonisaatiosta onkin huono.

Toistaiseksi ei ole tutkimusnäyttöä siitä, että PCR-paneeleja käyttämällä pystyttäisiin vähentämään, lyhentämään tai kohdentamaan potilaan saamaa antibioottihoitoa tai vaikuttamaan sairaalahoidon kestoon tai kustannuksiin. PCR-paneelien käyttö tulisi suunnata sellaisiin vakaviin, sairaalahoitoa vaativiin keuhkokuumeisiin, joissa hoidon tulee kattaa myös atyyppiset aiheuttajat.

Kirjallisuutta

  1. Serigstad S, Markussen D, Grewal HMS, ym. Rapid syndromic PCR testing in patients with respiratory tract infections reduces time to results and improves microbial yield. Sci Rep 2022;12(1):326 «PMID: 35013351»PubMed
  2. Andrews V, Pinholt M, Schneider UV, ym. Performance of PCR-based syndromic testing compared to bacterial culture in patients with suspected pneumonia applying microscopy for quality assessment. APMIS 2022;130(7):417-426 «PMID: 35499302»PubMed
  3. Rand KH, Beal SG, Cherabuddi K, ym. Performance of a Semiquantitative Multiplex Bacterial and Viral PCR Panel Compared With Standard Microbiological Laboratory Results: 396 Patients Studied With the BioFire Pneumonia Panel. Open Forum Infect Dis 2021;8(1):ofaa560 «PMID: 33447631»PubMed